Geneious软件

Geneious Prime将业界领先的生物信息学和分子生物学工具直接交给研究人员，简化了序列分析和获取洞察的过程。Geneious是由Biomatters公司开发的跨平台商业生物信息学软件，提供免费学术基础版与付费商业增强版，整合序列比对、进化树构建、引物设计、蛋白质结构分析等核心功能，支持GenBank、PubMed等数据库检索及协作模块.

Geneious Prime通过将原始数据转换为可视化的呈现，使序列分析变得直观且用户友好，从而使生物信息学变得容易访问。

桑格测序分析

简单的序列装配和易于编辑的contigs。基因预测、基序、翻译和变异调用的自动注释。

基因型微卫星跟踪与自动阶梯拟合和峰值调用，并生成等位基因表。

先进的序列分析

在高度可定制的序列视图中显示带注释的基因组和集合，并转化为美观的可视化图表。

强大的SNP变异分析、简单的RNA序列表达分析和扩增子宏基因组学。

分子生物学

一步模拟分子克隆，包括Gateway、Golden Gate和In-Fusion克隆。

设计和测试PCR和测序引物，并创建自己的可搜索引物数据库。

强大的CRISPR工具可以轻松查找站点、设计指导RNA和分析编辑结果。

NGS预处理、组装和绘图

使用广泛的NGS预处理工具进行准确的下游分析，产生干净的序列数据。

具有专属映射算法的可靠参考映射和可用于比较和整理的比对工具，可灵活的从头基因组组装。

排列与系统遗传学

使用可信的算法（包括MAFFT和Clustal Omega）对DNA或蛋白质进行成对和多重校准。

使用同行评审的算法（包括RAxML和PAUP*）构建系统发育树，并调整显示设置。

NCBI和BLAST

在NCBI的所有关键数据库中快速搜索文献、DNA和蛋白质序列信息。直接向GenBank提交序列。

BLAST根据NCBI数据库中的序列进行搜索，或建立本地数据库并在本地进行BLAST。