PyMOL开源分子三维结构可视化软件

PyMOL是一款开源的分子三维结构可视化软件，由Warren Lyford DeLano开发，并由DeLano Scientific LLC商业化。它主要用于生物大分子（如蛋白质）和小分子的三维结构展示与分析，支持从PDB数据库下载结构文件并进行高精度渲染。

核心功能  

- 结构可视化：支持Cartoon、Stick、Spheres等多种显示模式，可调整深度、雾效等参数优化观感 。 

- 交互操作：提供Slab工具裁剪遮挡区域、选择模式（如按残基、链或原子筛选）及命令行脚本扩展功能 。 

- 分析工具：内置叠合（Align）、距离测量（Wizard > Measurement）等功能，适用于结构比较与突变模拟 。 

使用场景  

- 教育与科研：常用于蛋白质结构教学、分子动力学分析及学术论文插图制作 。 

- 开源与商业版本：开源版本可免费下载，商业版（如PyMOL by Schrödinger）提供高级功能及技术支持 。

PyMOL

• ⽤于⽣物⼤分⼦（如蛋⽩质、DNA等）三维结构可视化的分⼦建模软件

• 提供分⼦可视化、图像渲染、结构优化、分⼦模拟和动态可视化等功能，⽀持与其他⽣物信息学⼯具的集成

• 精美的三维渲染效果，⽀持多种⽂件格式，适⽤于⼤分⼦结构分析和学术研究

• 适⽤于⽣物学家、药物化学家、结构⽣物学家、分⼦⽣物学研究⼈员等。